Il corso di dottorato interateneo ha sede amministrativa presso l’Università di Trieste. Per le attività di formazione, la sede è il Polo universitario di Gorizia, a cui si affiancano il Campus di piazzale Europa a Trieste e quello dei Rizzi a Udine. Il corso, pur gestito dal Dipartimento di Ingegneria e Architettura di Trieste, vede il contributo attivo del Dipartimento Politecnico di Ingegneria e Architettura di Udine. 

Il corso comprende, tra i propri organi di progettazione, programmazione e gestione, oltre al Collegio dei docenti (professori dei due Atenei, tra i quali è individuato un gruppo preposto alla qualità dell’offerta formativa e di ricerca), un Consiglio con ruolo di advisory board scientifico per le attività di formazione. Al Consiglio partecipano professori ed esperti di diverse discipline provenienti dai due Atenei e da altre Università straniere. Per dare spazio ad attività strutturate e periodiche di dialogo, confronto e aggiornamento con ordini professionali, aziende, associazioni di categoria ed ex alumni, sono istituiti due Comitati di indirizzo (uno per ciascun curriculum). 

Inoltre, dottorandi e docenti del dottorato ogni anno partecipano ad eventi organizzati da altri atenei (in presenza e a distanza) su temi attinenti all’evoluzione scientifica delle aree di riferimento. 

Oltre ai rappresentanti degli studenti, il dottorato favorisce il dialogo costante e aperto con i dottorandi, attraverso l’organizzazione di incontri periodici seminariali su attività di ricerca e formative e loro prospettive di integrazione e miglioramento.