Il programma di Dottorato ha una struttura innovativa, che include diverse tipologie di attività di formazione.

Il Dottorato SFIPOL offre un percorso interdisciplinare con due curricula: Studi Storici e Studi Filosofici e Politico-Sociali. Il programma formativo comprende corsi e seminari su temi metodologici, storico-filosofici e politico-sociali, mirati a sviluppare competenze metodologiche, teoretiche e storiografiche per una preparazione completa e multidisciplinare. Le attività didattiche includono 80 ore di formazione obbligatoria, distribuite su tre anni: il primo anno con moduli comuni e il secondo con percorsi differenziati. 

La formazione va oltre la didattica frontale, includendo attività seminariali e laboratoriali per sviluppare competenze tecniche e trasversali, come gestione di progetti di ricerca, elaborazione dei dati e valorizzazione della proprietà intellettuale. Particolare attenzione è data alla diffusione del sapere umanistico, anche attraverso strumenti digitali per la comunicazione scientifica. Il dottorato promuove la partecipazione a conferenze, workshop e soggiorni di ricerca all'estero, favorendo il contatto con la comunità scientifica internazionale. 

Ogni dottorando/a ha un progetto formativo individuale, elaborato con il supervisore e approvato dal Collegio, che definisce le attività previste, inclusi eventuali periodi all'esterno. Il Collegio valuta annualmente il raggiungimento degli obiettivi per l’ammissione all’anno successivo e la valutazione della tesi.