Il programma di Dottorato ha una struttura innovativa, che include diverse tipologie di attività di formazione.

Il corso di dottorato offre una serie di corsi di terzo livello ed attività seminariali comune a tutti i dottorandi/e volta ad approfondire aspetti teorici e sperimentali di base, trasversali a tutte le aree incluse nel corso. Ogni dottorando/a è lasciato/a libero/a di individuare insieme al proprio supervisore corsi/insegnamenti/seminari specifici e funzionali al proprio progetto di ricerca. Il collegio offre anche cicli periodici di seminari su tematiche diverse invitando relatori esterni. Il calendario delle attività viene annualmente aggiornato in rapporto alle tematiche di ricerca sviluppate dai dottorandi per consentire loro di approfondire diverse aree di interesse all’interno dei propri campi di studio. Le attività formative sono svolte in inglese. 

Sulla base delle linee guida per la didattica dei corsi di dottorato di ricerca dell’Università di Trieste, il/la dottorando/a deve conseguire obbligatoriamente 20 CFU entro la fine del triennio. Il corso di dottorato promuove lo svolgimento di periodi all’estero, la partecipazione a convegni nazionali ed internazionali, come anche il perfezionamento linguistico e l'approfondimento di tematiche legate alla gestione dei dati, alla proprietà intellettuale ed alla scrittura di progetti scientifici attraverso le attività didattiche trasversali offerte dall'ufficio dottorati dell'Ateneo di Trieste.